優勢學科 院系設置：
本科為6個學士學院，分別為：Revelle College（瑞威爾學院），John Muir College（約翰·繆爾學院），Thurgood Marshall College（瑟古德·馬歇爾學院），Earl Warren College（厄爾·沃倫學院），Eleanor Roosevelt College（埃莉諾·羅斯福學院），Sixth College（第六學院）。
不論學生選擇哪個學院，他可以在加州大學圣迭戈分校所提供的任何學科里獲得學士學位。但是學院向學生頒發學士文件和舉行每個學員特有的畢業典禮。
研究生共設4個學部、5個學院和1個研究所，分別是：藝術與人文部（Division of Arts & Humanities），生物科學部（Division of Biological Sciences），理學部（Division of Physical Sciences），社會科學部（Division of Social Sciences），工程學院（Jacobs School of Engineering），商學院（Rady School of Management），全球政策與戰略學院（School of Global Policy and Strategy），醫學院（School of Medicine），藥學院（Skaggs School of Pharmacy & Pharmaceutical Sciences），海洋所（Scripps Inst. of Oceanography）。
